Dentro de las principales funciones del laboratorio de Bacteriología y Micología de la FMVZ-UAS, está el brindar apoyo a las distintas Unidades de Aprendizaje (Bacteriología y Micología Veterinaria, Fundamentos de Cirugía, Biología Celular y del Desarrollo, Inspección Sanitaria, Nutrición Animal, Producción de Leche en Bovinos, etc.) en la realización de las prácticas de laboratorio que requieran. Asimismo, éste laboratorio brinda apoyo en instalaciones y soporte técnico en diversos trabajos de investigación a docentes investigadores, tesistas, alumnos de estancias profesionales supervisadas, seminarios de patología y prestadores de servicio social.

Por último, dentro de sus funciones el laboratorio presta servicio de diagnóstico bacteriológico y/o micológico de los principales agentes causales de enfermedades en animales de producción, compañía y vida silvestre.